近日，中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研究所石正麗與崔杰課題組在我國(guó)云南省發(fā)現(xiàn)了一處蝙蝠 SARS 樣冠狀病毒的天然基因庫，揭示了 SARS 冠狀病毒可能的重組起源。

蝙蝠是 SARS 樣冠狀病毒的自然儲(chǔ)存宿主。自2005年以來，多個(gè)研究團(tuán)隊(duì)在我國(guó)及歐洲地區(qū)的多種菊頭蝠中發(fā)現(xiàn)了越來越多的 SARS 樣冠狀病毒。但是，大部分蝙蝠 SARS 樣冠狀病毒的刺突蛋白基因和部分附屬基因與 SARS 冠狀病毒差異明顯。目前已報(bào)道的蝙蝠 SARS 樣冠狀病毒至少在兩個(gè)基因上與 SARS 冠狀病毒存在較大分化。因此，它們都不是造成2002-2003年疫情的 SARS 冠狀病毒的直接祖先。雖然目前已有充分證據(jù)表明蝙蝠是 SARS 病毒的源頭，但有關(guān) SARS 如何在蝙蝠中進(jìn)化產(chǎn)生、從哪里的蝙蝠種群中出現(xiàn)等問題還未得到解答。 

武漢病毒所石正麗與崔杰課題組自2011年起對(duì)云南省一處洞穴的菊頭蝠種群開展了為期5年的 SARS 樣冠狀病毒的長(zhǎng)期監(jiān)測(cè)，共進(jìn)行10次樣品采集，在64份蝙蝠糞便粒和肛拭子樣品中檢測(cè)到 SARS 樣冠狀病毒 RNA。對(duì)這些 SARS 樣冠狀病毒 S 基因受體結(jié)合區(qū)的擴(kuò)增與分析結(jié)果顯示，流行于這一洞穴的蝙蝠SARS樣冠狀病毒高度多樣，可分為兩大簇，其中一簇在 RBD 區(qū)更接近 SARS 病毒，不存在大部分 SARS 樣冠狀病毒所出現(xiàn)的缺失。課題組對(duì)11株新發(fā)現(xiàn)的 SARS 樣冠狀病毒進(jìn)行了全長(zhǎng)基因組擴(kuò)增，并對(duì)15株在該洞穴發(fā)現(xiàn)的毒株（含4株前期已報(bào)道的毒株）進(jìn)行了全基因組序列分析。

結(jié)果表明，流行于該洞穴的蝙蝠 SARS 樣冠狀病毒在非結(jié)構(gòu)蛋白基因 ORF1ab 上彼此相近，然而它們的 S 基因和 ORF8 基因卻呈現(xiàn)極為豐富的遺傳多樣性。重要的是，在 S 基因的 N 端區(qū)域、RBD 區(qū)、ORF3、ORF8 等4個(gè)基因組高變區(qū)上分別與 SARS 病毒高度同源的 SARS 樣冠狀病毒均存在于該洞穴的蝙蝠中。也就是說，SARS 冠狀病毒的全部基因組組分都可以在這個(gè) SARS 樣冠狀病毒的天然基因庫中找到。通過進(jìn)一步重組分析，課題組在這些 SARS 樣冠狀病毒 S 基因內(nèi)部和 ORF8 附近等多個(gè)位點(diǎn)發(fā)現(xiàn)了頻繁重組的證據(jù)，并推測(cè) SARS 冠狀病毒的直接祖先可能通過這些蝙蝠 SARS 樣冠狀病毒的祖先株之間發(fā)生的一系列的重組事件而產(chǎn)生。 

此外，該研究通過反向遺傳學(xué)方法，將新發(fā)現(xiàn)毒株的S基因替換到已構(gòu)建的WIV1株SARS樣冠狀病毒全長(zhǎng)感染性克隆上，并對(duì)三株新發(fā)現(xiàn)的S基因不同的SARS樣冠狀病毒的跨種傳播能力進(jìn)行了評(píng)估。結(jié)果顯示，S基因不存在缺失的多株SARS樣冠狀病毒均可在Vero E6細(xì)胞中有效復(fù)制，并可使用與SARS病毒相同的受體——人ACE2入侵HeLa細(xì)胞。除S基因以外，課題組對(duì)新發(fā)現(xiàn)的蝙蝠SARS樣冠狀病毒中遺傳多樣的ORF8也進(jìn)行了初步的功能研究，發(fā)現(xiàn)不同基因型的ORF8均具有和SARS病毒ORF8相類似的活化轉(zhuǎn)錄激活因子6（ATF6）的功能；而首次發(fā)現(xiàn)的具有和晚期SARS冠狀病毒類似的ORF8a/8b的蝙蝠SARS樣冠狀病毒Rs4084株，其ORF8a也表現(xiàn)出誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡的功能。 

該研究為認(rèn)識(shí)SARS冠狀病毒的起源與進(jìn)化提供了新的見解，揭示了我國(guó)蝙蝠攜帶有不同株具有跨種傳播至人群可能性的SARS樣冠狀病毒，并為相關(guān)疾病的預(yù)防提供了重要依據(jù)。 

相關(guān)研究成果在線發(fā)表于病原學(xué)期刊 PLoS Pathogens 上。文章在線發(fā)表后，被 PLoS Pathogens 列為本周推薦文章。12月1日，Nature news 對(duì)此進(jìn)行了報(bào)道，指出該發(fā)現(xiàn)回答了關(guān)于 SARS 病毒起源遺留的問題，援引香港大學(xué)微生物學(xué)家袁國(guó)勇的評(píng)論：“這項(xiàng)發(fā)現(xiàn)告誡我們需減少對(duì)蝙蝠等野生動(dòng)物棲息地的侵?jǐn)_、杜絕野生動(dòng)物市場(chǎng)交易，這對(duì)于防止新發(fā)傳染病的發(fā)生至關(guān)重要”。

（看看新聞Knews記者：張幗霞 實(shí)習(xí)編輯：蔡悅揚(yáng)）